[1]刘慧萍,陈永勤,黄毅,等. 甘蓝型油菜SHR蛋白基因鉴定与结构分析[J].湖北大学学报(自然科学版),2017,(06):620.
 [J].,2017,(06):620.
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 甘蓝型油菜SHR蛋白基因鉴定与结构分析()
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《湖北大学学报(自然科学版)》[ISSN:1000-2375/CN:42-1212/N]

卷:
期数:
2017年06期
页码:
620
栏目:
出版日期:
2017-11-05

文章信息/Info

作者:
 刘慧萍12陈永勤1黄毅2顿小玲2
关键词:
 关键词:甘蓝型油菜SHR基因基因结构氨基酸序列三级结构
文献标志码:
A
摘要:
 摘要:植物SHR蛋白属于GRAS蛋白转录因子家族,保守羧基端含有VHIID结构域,氨基端不保守,参与调控植物物质合成和生长发育.参照拟南芥AtSHR基因的CDS序列,采用生物信息学的方法在甘蓝型油菜数据库中鉴定出3个BnSHR基因,进而分析其基因结构、生化特性、进化关系和蛋白结构.研究结果显示3个BnSHR基因中有2个位于C基因组(来源于甘蓝)上,1个位于A基因组(来源于白菜);3个BnSHR基因的氨基酸序列一致性为88.25%,与AtSHR基因在进化上也高度同源,SHR基因在结构和功能上保守;亚细胞定位预测显示BnSHR蛋白可能定位于过氧化物酶体,参与种子萌发过程中脂肪转变为糖分的过程;PHYRE2预测了BnSHR蛋白的三级结构,由于序列的差异性导致了氨基末端处结构相差较大,但VHIID保守区结构类似,为β折叠.
更新日期/Last Update: 2017-11-06